إن تحسين فرص الحصول على المياه والنظافة والصرف الصحي يشكل عنصراً مهما في الحد من معدل وفيات ومرض الأطفال دون سن الخامسة من العمر، ووفقاً لنتائج المسح العنقودي متعدد المؤشرات لعام 2006م فإن أكثر من نصف سكان اليمن يعيشون في مساكن مزودة بمرافق صرف صحي محسنة (52 %) تتراوح بين 92 % في المناطق الحضرية و 33 % في المناطق الريفية، وبحسب نتائج المسح العنقودي فإن سكان المناطق الريفية، 27 % يستخدمون حفراً من دون غطاء (بيارات مفتوحة)، إلا أن 31 % يفتقرون إلى المرافق أصلاً، في حين أن الوسيلتين الأكثر شيوعاً في المناطق الحضرية هما المراحيض المتصلة بشبكات صرف صحي أو حفر مغطاة (بيارات مغطاة).